Studienprotokolle werden durch die Organgruppen erarbeitet. Darüber hinaus können auch uro-onkologisch tätige Einrichtungen außerhalb der AUO oder Unternehmen der pharmazeutischen Industrie Studienprotokolle einbringen und so zum Erreichen der Ziele der AUO beitragen.

Die Organgruppen beobachten die Studienlandschaft ihrer jeweiligen Tumorerkrankung und fördern und unterstützen die Initiierung von Studien. Die im AUO-Klinikverbund organisierten uro-onkologisch tätigen Abteilungen sind maßgeblich an der Durchführung der Studien beteiligt.